《闪电十一人2：威胁的侵略者》是2008年Level5于推出的热血足球RPG游戏《闪电十一人》的续作，作为这次游戏的正统续作，双版本将会拥有完全不同的两套剧本，合计登场球员将大幅度超越前作的1000人，达到了1500人，同时过去所支持的双人对战游戏在这次进化成为了四人对战。而在游戏中登场的可加入球员也会因版本的不同而不同，令整款游戏拥有双重乐趣。
睡懒觉的元堂守被母亲从床上喊醒，迷糊中才想起今天还要去练习，急急忙忙的吃完早饭，出门刚好遇到路过的木野秋，一起前往河川敷。
目标：前往河川敷。往下走会遇到人告诉我们关于存档和恢复点的事情，随后和老爷爷对话，也会教我们一些包括地图图示之类的基础内容，随后离开地图，前往河川敷，向右来到训练场与伙伴们对话。
迟到了被埋怨的元堂大呼“抱歉，抱歉”，交谈中元堂发现豪炎寺不在，原来他去看妹妹夕香了，而土门和一之濑则去了木户川清修。随后大家回忆起一周前获得日本全国大赛第一时的景象，畅想着挑战世界的梦想，突然一声怪声惊扰了众人，天空中一颗带着紫黒色火焰的奇怪物体飞逝而过，流星吗，又一声巨响，众人发现流星所落的地方正是雷门中学的方向，急忙跑向学校。
另一方面，在医院看望妹妹的豪炎寺惊喜的发现夕香终于从沉睡中醒来(感动)，夕香就这样没事了，不得不说是奇迹一般，然而两声巨响打破了这温馨的时刻，门外一个神秘的身影悄悄的窥视着。
目标：前往雷门中。
来到雷门中学前，音无春奈慌张的跑上前来告诉众人发生了大事情，遥遥望去，原本的雷门中学变成了一片废墟，废墟之上，黑色的人影赫然出现。
这次游戏双版本的最大区别，则在于登场的最强劲敌的不同，在过去的情报中，本作雷门中学球队将要挑战宇宙人级别的球队，双版本中所登场的最大对手将分别为《烈焰》——热焰队中如同烈火版热血的少年主将“樊”，《寒冰》——钻石星尘队中如同冰雪般冷酷的主将“加泽”。究竟元堂守和豪炎寺与吹雪士郎的另一队冰火组合，能否击败他们？
游戏中登场的球员等角色超过1000名，游戏还支持通过无线进行对战等操作。
游戏的音乐部分由曾经制作过《时空之轮》等大作音乐的光田康典负责，而动画部分则由制作剧场版和TV版《口袋妖怪》的OLM负责。
